La fédération de Budo Nin-Jitsu France est la première fédération à regrouper plus d'une vingtaine de clubs en France. Elle a été créée le 29 décembre 1994, sur des bases préparées trois ans plus tôt. La F.B.N.F est l'unique fédération en France à offrir une structure sérieuse aux clubs affiliés. La F.B.N.F met à disposition des clubs affiliés juristes, comptables, conseillers financiers, et propose de nombreux stages de remise à niveau pour ses instructeurs durant lesquels divers intervenants comme des conseillers médicaux, complètent la formation technique par une formation théorique portant sur la connaissance du corps humain et des conséquences de l'entrainement sur celui-ci.

La F.B.N.F, transmet l'enseignement du ninjutsu de Maître HATSUMI, et compte dans son équipe technique des instructeurs renommés qui participent à la majorité des stages organisés avec le Maître Hatsumi en Europe. Certains vont même jusqu'à faire le déplacement au Japon pour rencontrer celui-ci. Grace au nombre croissant de ses adhérents, la FBNF peut proposer des licences à des tarifs des plus raisonnables (80 Fr/adhérent), ainsi que des affiliations à moindre coût (200 Fr/club).